火龍果,屬仙人掌科量天尺屬和蛇鞭柱屬植物,北方地區主要采用日光溫室進行種植。本研究上海博訊醫療生物儀器股份有限公司以成熟期紅肉火龍果為試材,通過改良CTAB法進行總DNA提取,旨在探求紅肉火龍果果肉、果皮及種子中DNA的含量情況,為進一步從分子遺傳學角度進行紅肉火龍果各類型遺傳背景研究提供依據。
儀器
高速離心機(德國EPPendorf)、移液槍(德國EPPendorf)、紫外分光光度計 (德國EPPendorfBiophotometer)、凝膠成像系統(北京六一)、恒溫水浴鍋(上海博訊)、電泳儀(北京六一)、電泳槽(北京六一)等。
上海博迅HH.S21-6電熱恒溫水浴鍋
1 紅肉火龍果果實不同部位DNA質量濃度不同
通過改良CTAB法對紅肉火龍果果肉、果皮、種子部位進行DNA提取,結果表明成熟期紅肉火龍果果肉、果皮、種子均可有效提取DNA,但提取的DNA質量濃度略有差異,如從種子中提取的DNA質量濃度0.135μg·ml-1,果皮中提取的DNA質量濃度0.078μg·ml-1,果肉中提取的DNA質量濃度0.036μg·ml-1,種 子 中DNA質量濃度大約是果皮中DNA質量濃度的1.73倍,果肉中DNA質量濃度的3.75倍;果皮中DNA質量濃度是果肉中DNA質量濃度的2.17倍。
2 改良CTAB法去除雜質效果好
成熟期紅肉火龍果果實中含有較多的糖類、蛋白質、酚類等次生物質,嚴重影響DNA的提取質量和純度。上海博訊試驗結果表明:通過改良CTAB法提取的紅肉火龍果果肉、果皮、種子中的DNA濃度均超過0.030μg·ml-1,說明提取物中糖、蛋白質、多酚、酶等干擾物質去除較好,能夠為進一步研究提供高質量的DNA。
3 研磨及裂解時間非常關鍵
為了能夠獲得高質量的DNA,紅肉火龍果果肉、果皮、種子在研磨時應加入充足的液氮,并迅速研磨,使果肉、果皮呈粉色粉末,種子成白色粉末,研磨好后迅速轉移至離心管中,迅速加入CTAB緩沖液,充分搖勻,在65℃ 水浴中反應60min,進行裂解。裂解時間短,DNA釋放不完全,時間長DNA降解嚴重,因此,破壁好壞及細胞裂解時間長短對于DNA的得率至關重要。
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